找回密码
 注册

微信登录

微信扫一扫,快速登录

萍聚头条

查看: 266|回复: 0

最近AI发文好火啊,Nature Cancer自主AI代理显著提升肿瘤临床决策准确性

[复制链接]
发表于 2025-6-6 22:18 | 显示全部楼层 |阅读模式

马上注册,结交更多好友,享用更多功能,让你轻松玩转社区。

您需要 登录 才可以下载或查看,没有账号?注册 微信登录

×
作者:微信文章
(800/年独享云服务器👆)人工智能新突破:自主 AI 代理显著提升肿瘤临床决策准确性

昨天,一项由多国科研人员合作完成的研究在《Nature Cancer》期刊发表,揭示了一种整合多模态精准肿瘤学工具与大型语言模型的自主人工智能(AI)代理,能显著提升肿瘤临床决策的准确性和可靠性。该研究由海德堡大学医院、德累斯顿工业大学等机构的科学家主导,为 AI 在肿瘤学中的临床应用开辟了新路径。

w1.jpg

研究背景:肿瘤临床决策的复杂性与 AI 的潜力

肿瘤临床决策需要整合影像学、病理学、基因组学等多模态数据,以及最新的治疗指南和研究成果,对医生的专业要求极高。近年来,大型语言模型(如 GPT-4)在医疗领域展现出一定应用潜力,但其单模态特性和知识局限性,难以满足肿瘤诊疗的复杂需求。传统 AI 模型在处理肿瘤病例时,常常因缺乏多维度数据整合能力,导致决策不够精准。开发一个能自主调用多种专业工具的 AI 代理,其像肿瘤专家一样综合分析各类信息,为患者提个性化诊疗建议,非常重要。

w2.jpg

技术突破:多模态工具与 LLM 的深度融合

该研究团队开发的 AI 代理以 GPT-4 为核心,整合了三大类关键工具:

影像与病理分析工具:包括用于检测微卫星不稳定性(MSI)和 KRAS、BRAF 基因突变的视觉 Transformer 模型,以及 MedSAM 医学图像分割模型,可从 CT/MRI 扫描和病理切片中提取关键信息。

w3.jpg

知识检索工具:通过 OncoKB、PubMed 和 Google 等平台,实时获取精准肿瘤学数据库和最新文献。

计算与推理工具:集成计算器和 Python 解释器,用于量化肿瘤进展、药物剂量计算等。

此外,研究团队构建了包含约 6800 份肿瘤学指南和医学文献的知识库,通过检索增强生成(RAG)技术,确保 AI 代理的决策有权威证据支持。

w4.jpg

关键发现:AI 代理显著超越单一 LLM 表现

研究团队基于 20 个真实的多模态肿瘤病例(涵盖结直肠、肝胆等癌症类型),对 AI 代理的性能进行了严格测试,获得了以下突破性结果:

工具调用准确性:在 64 次必要工具调用中,AI 代理正确使用 56 次,成功率达 87.5%,且未出现因工具误用导致的决策失误。

临床结论正确性:AI 代理在 91.0% 的病例中给出了正确的临床结论,相比之下,仅使用 GPT-4 的正确率仅为 30.3%。

指南引用精准度:在提供的 257 条引用中,75.5% 准确对应权威肿瘤学指南,有效减少了 “幻觉” 现象(即生成看似合理但错误的信息)。

w5.jpg

w6.jpg

w7.jpg
这种‘模块化 AI’模式避免了开发‘全能型’大模型的技术挑战,每个工具可独立验证和更新,更符合医疗监管要求。
如下图片均由我们800/年的独享生信云服务器画出,带有root权限(预装2万个包+SCP单细胞生信环境,后续有啥好用的环境,我们会继续装),需要画图试试的可以免💰领测试号:当前服务器不好用,咱就自己造,我们一定要让大家生信学习的门槛降到最低

对服务器或生信交流群感兴趣的可以联系小助手:sx_qtx01

我们上游数据分析交付的结果还有一个长的细化的结果文件结构目录解读(太长了,这里就不展示了),想了解的可以联系小助手vx,发给大家,有分析需求的可以了解下方分析内容没有服务器,单细胞数据搞不定?看看我们做出来的结果包含啥?我们目前做好了这些pipeline,可以帮你做






Ferber, D., El Nahhas, O.S.M., Wölflein, G. et al. Development and validation of an autonomous artificial intelligence agent for clinical decision-making in oncology. Nat Cancer (2025).

后苔↩️之前贴子的岸号即可霍得之前的

代码,今日关键词:250607
基础、单细胞、空间各专题班,想系统性学习可以看下这个👇

不吹不黑,你想知道生信需要掌握哪些,光看这个大纲就会有不少收获



有单细胞数据分析需求的可以看👇这个文章

没有服务器,单细胞数据搞不定?我们目前做好了这些pipeline,可以帮你做(近期又添加了21 年发表在了 Cell上面的单细胞转录组分析代谢的分析——compass)

我们目前主要的分析内容看👇(这次的是对上次内容的补充 scBCR和 sc-TCR了)顶刊用啥分析,咱们就用啥,完全按照他们的做
# 肿瘤学临床决策自主人工智能代理仓库  **⚠️ 重要提示**:此仓库目前处于开发阶段,未来使用方式可能调整。当前代理实现使用测试函数模拟图像分割和基因分析功能(正式环境需替换为临床验证工具)。  
## 软件要求  所有实验基于2023款Apple MacBook Pro M2 Max(96GB内存)运行。  **硬件建议**:若需加速模型运算,建议配备支持CUDA的GPU(非必需)。  
## 通用设置指南  ### 1. Python安装  从源码安装Python 3.11.6(项目全程使用此版本)。  
### 2. 依赖安装  # 克隆仓库(耗时约1分钟)git clone https://github.com/Dyke-F/LLM_RAG_Agent.git
# 创建并激活Python虚拟环境python3 -m venv medvenvsource medvenv/bin/activate
# 安装项目依赖pip install -r requirements.txt## 仓库结构说明  .├── .env                      # 环境变量配置文件(存放API密钥等敏感信息)└── RAGent/                      ├── agent_tools_dummy.py   # 代理工具虚拟实现(返回默认值,用于快速调试演示)    ├── agent_tools.py         # 代理工具实际实现(含影像分析、知识库检索等功能)    ├── chroma_db_retriever.py # RAG检索器类(基于DSPY修改,支持HTTP客户端调用)    ├── citation_utils.py      # 引用校验工具(验证代理输出的指南引用准确性)    ├── deduplicate_data.py    # 数据去重脚本(移除重复医学文献)    └── ...(其他功能模块)## 实验运行步骤  ### 1. 下载医学指南  **示例**:Meditron指南可从[Hugging Face](https://huggingface.co/datasets/epfl-llm/guidelines)获取,使用`scrape_meditron.py`脚本下载时需指定存储目录。  
### 2. 构建RAG知识库  # 示例代码:初始化向量数据库并导入指南文档from chroma_db_retriever import RAGRetrieverretriever = RAGRetriever(embedding_model="text-embedding-3-large")retriever.build_knowledge_base(guidelines_dir="data/guidelines")### 3. 运行代理测试  # 执行多模态病例测试(需提前准备患者数据)python run_agent.py --case_id=001 --tool_mode=real## 核心功能说明  1. **多模态工具集成**:     - 影像分析:通过MedSAM实现肿瘤分割(`agent_tools.py`中`run_medsam()`函数)     - 病理检测:使用Vision Transformer预测MSI/KRAS/BRAF突变(`predict_genetics()`函数)     - 知识检索:对接OncoKB/PubMed/Google(`search_oncokb()`和`pubmed_query()`函数)  
2. **RAG增强推理**:     - 基于Chroma向量数据库检索6800+肿瘤学指南     - 通过Cohere模型重排序检索结果,降低"幻觉"风险  
3. **临床决策流程**:     ```mermaid   graph TD   A[输入病例] --> B[工具调用决策]   B --> C1[影像分割]   B --> C2[基因检测]   B --> C3[文献检索]   C1-C3 --> D[RAG证据整合]   D --> E[生成治疗建议]   ```  
## 注意事项  1. **数据隐私**:使用GPT-4等云服务时需遵守HIPAA/GDPR规范,建议本地部署开源模型(如Llama-3)。  2. **临床验证**:当前工具链需替换为经FDA/CE认证的医疗设备(如MSIntuit替代测试版突变检测模型)。  3. **更新日志**:最新功能迭代见[Releases](https://github.com/Dyke-F/LLM_RAG_Agent/releases)页面。  
**项目地址**:https://github.com/Dyke-F/LLM_RAG_Agent  **联系作者**:Jakob-Nikolas.Kather@alumni.dkfz.de(德累斯顿工业大学数字健康中心)  
### 注释说明  - **符号标注**:`#` 后为行内注释,**粗体**突出关键操作,代码块使用```语法高亮。  - **功能映射**:仓库结构与论文中"工具链-知识库-推理"三模块完全对应,便于复现研究结果。
Die von den Nutzern eingestellten Information und Meinungen sind nicht eigene Informationen und Meinungen der DOLC GmbH.
您需要登录后才可以回帖 登录 | 注册 微信登录

本版积分规则

Archiver|手机版|AGB|Impressum|Datenschutzerklärung|萍聚社区-德国热线-德国实用信息网

GMT+2, 2025-9-12 15:12 , Processed in 0.178318 second(s), 30 queries .

Powered by Discuz! X3.5 Licensed

© 2001-2025 Discuz! Team.

快速回复 返回顶部 返回列表