有什么办法能够方便的验证pathway假设？

orionsnow

有什么办法能够方便的验证学说假设？


我最近帮同事处理他的试验数据， 材料是从野外采集来得，经过提炼之后，提炼物在送到其他实验室做色谱分析，现在我看到的是最后的色谱data。

一共有6组材料， 其中有一组材料的化学组分明显和其他各组部分很不一样，但是部分还是有规律可寻。

现在我们比较倾向的结论是他发现了一个新变种，是突变体，但是总感觉这个是几百万年的一个过程。

或者是环境太恶劣，导致 pathway 改变造成的。

这两个好办，设计一个引种试验把它引到平原上再种一季，测一次就知道了。 不过实施起来有点麻烦，大概还要等最少1，2年时间才能有结果。 替代的办法就是建立一个关于pathway 微分方程， 把pathway 被改变的过程给它模拟出来。 不过这个话题本身也够写个文章了，麻烦。

我个人的另外一个怀疑就是我这个同事采集样本的时候手抖了，拔了一个别的什么很相似属的植物。 根据他写文章丢三落四一个表格发三次的性格，这种事情还是有概率发生的。 但是我又不能直接问人家，“你确定不是你手抖了么？” 不知道reviewer 到时候会不会替我问。 我记得他好像每次采集都有拍照片的，也许让他把这个特别组的照片也提供一下好点。

现在感觉只能用不却定的口气来叙述说，“我们可能发现了一个新变种， 和一个在这种植物里的新pathway。 具体验证估计还要过两三年才能完成。”

neuron

必须要在植物体上做试验么？如果在细胞里面会不会快一些。

orionsnow

必须要在植物体上做试验么？如果在细胞里面会不会快一些。
neuron 发表于 2011-3-1 20:18

恩，这可真是个好主意。 我回头去查查文献，有可能这个领域里头有人已经解决过类似的了。

1976 年有人在细胞外做过酶验证的实验。

neuron

比如你有普通植物细胞，转染上你认为是新的pathway里面的关键酶的DNA，发现原来的细胞可以成功利用新的酶，走新的代谢途径。。。。

orionsnow

比如你有普通植物细胞，转染上你认为是新的pathway里面的关键酶的DNA，发现原来的细胞可以成功利用新的酶， ...
neuron 发表于 2011-3-2 02:11

你这个步骤太深入了，我们现在还没有到那个层次，只从组分上进行了一些分析。不过以后应该会考虑的。